Die Agglomerationspolitik des Bundes verlangt von den Agglomerationen, im Abstand von vier Jahren Agglomerationsprogramme zu erstellen, in denen die Raumplanungs- und Mobilitätspolitik festgelegt wird. Agglomerationsprogramme, die als wirksam eingestuft werden, erhalten Bundesbeiträge für die Umsetzung konkreter Massnahmen .

Die Agglo Freiburg hat 2009 für die erste Generation (AP1), 2011 für die zweite Generation (AP2), 2016 für die dritte Generation (AP3) und 2021 für die vierte Generation (AP4) ein Agglomerationsprogramm eingereicht. Derzeit arbeitet sie an einem Agglomerationsprogramm der fünften Generation (AP5).

Die Programme der Agglomeration Freiburg (AP1, AP2, AP3, AP4) haben von Bundeszuschüssen in Höhe von mehreren Millionen Franken profitiert. Die Agglomeration kofinanziert und koordiniert die Umsetzung dieser Massnahmen mit den verschiedenen betroffenen Gemeinden.